BioWin中普通异养菌的好氧衰减速率为0.62/天，而在Metcalf&Eddy出版的经典教材以及GlennDiagger编写的教材中该参数值约为0.1。这种数据的差异是由于BioWin中使用了“Death-Regeneration”方法来模拟异养菌的衰减过程，而这些教材中使用了内源呼吸法(EndogenousRespiration)来模拟这一过程。对于内源呼吸法，在模拟微生物衰减的过程中需要有电子受体的存在，这些电子受体可以是氧气、硝酸盐或亚硝酸盐，因此该方法无法模拟厌氧条件下微生物的衰减，所以Dold,Ekama以及Marais (1980)开发出了“Death-Regeneration”方法，可以方便地模拟在好氧、缺氧及厌氧条件下的衰减。
这两种方法在模拟微生物衰减过程时，理论上会得出同样的结果，也就是说两种方法得出的微生物的净减量、内源呼吸残留物以及衰减相关的耗氧量是一致的。
